迷你鹦鹉鱼是体外受精， 亲鱼会选择较平整光滑的地方产卵， 可以在饲养缸内放置鲷罐或光滑塑料板供其产卵及受精卵的附着。

亲鱼会将产卵场地啃食干净， 雌鱼先将卵产在陶罐内壁， 紧接着雄鱼产出精子， 即完成受精。初次繁育的亲鱼产卵可达100枚左右， 随着亲鱼年龄的增加产卵数不断增加， 个别种鱼产卵数可高达400枚左右。

孵化期间由亲鱼照顾受精卵， 亲鱼通过不停地煽动鱼鳍来提供足够氧气供受精卵孵化。